抗稻瘟病基因Pi-3在水稻第9染色体上的确证
Confirmation of the blast resistance gene Pi-3 on rice Chromosome 9
分子标记种类和数量的大量涌现带动了稻瘟病抗性基因的定位和发展.近年来,利用DNA分子标记定位了一系列稻瘟病抗性基因,这些为水稻稻瘟病抗性基因的克隆和抗稻瘟病品种的选育打下了坚实的基础. 水稻抗稻瘟病基因Pi-3是一个具有广谱抗性的主效显性基因,精细定位和克隆Pi-3基因不仅可以帮助我们理解水稻抗稻瘟病的分子机理和拓宽稻瘟病抗性基因源,同时对培育抗病基因的累加品种具有重要意义. 本文利用CO39为遗传背景的近等基因系中的C104PKT和A57-119及其杂交F2代群体为材料,在何月秋教授将Pi-3基因初步定位在第9染色体分子标记G103 6.2cM和R14 1.7cM之间的基础上设计引物JJ6242和JJ6782,同时利用文献中报导的一对引物JJ113-T3,以便确证Pi-3基因在水稻第9染色体上的位置. 分别用3对引物JJ6242、JJ6782和JJ113-T3 PCR扩增2个亲本、CO39近等基因系和F2群体DNA样品,结果表明这3对引物在亲本中均能扩增出多态性条带,且在NILs和F2群体中出现与抗病基因Pi-3共分离.3个标记6242(10606).t00012、6782(10355).t00012和JJ113-T3与Pi-3间的卡平方值(χ2)分别为2.87、0.01和0.23,均符合连锁遗传的概率值范围(卡平方χ20.05=5.99).而这3个标记均在第9染色体上,表明Pi-3亦位于第9染色体上,而不是以前他人报导的第6或第12染色体上. 本研究利用遗传统计作图软件Mapmaker/EXP3.0对接种数据、PCR扩增带的数据进行统计分析,找到了3个位于Pi-3基因一侧的连锁标记JJ113-T3、6782(10355).t00012和6242(10606).t00012,它们与Pi-3间的遗传距离分别为5.4cM、16.2cM和21.7cM.并绘制了Pi-3在第9染色体上的部分遗传图谱.??
- 作者：
- 许凤华
- 学位授予单位：
- 云南农业大学
- 专业名称：
- 植物病理学
- 授予学位：
- 硕士
- 学位年度：
- 2006年
- 导师姓名：
- 何月秋
- 关键词：
- Pi-3；分子标记；基因定位；稻瘟病
- Pi-3；Molecular maker；Gene localization；Rice blast