乌骨绵羊酪氨酸酶相关蛋白1基因(TYRP1)多态性与乌骨绵羊乌质性状的关联分析
Associate Analysis on Polymorphism of TYRP1 with Black Traits in the Black-Boned Sheep (Ovis aries)
为探索乌骨绵羊乌质性状形成的分子机制,本研究选取了乌骨绵羊、兰坪本地绵羊和罗姆尼绵羊3个类型的绵羊群体,通过设计8对特异引物、PCR扩增、测序,得到了绵羊TYRP1基因的全序列,拼接CDS全长为1614bp,编码537个AA,并对绵羊TYRP1基因的结构进行预测.通过对三种绵羊TYRP1基因序列的比对发现基因序列上有12个多态位点,其中6个在内含子上,6个在编码区,在编码区的多态位点分别在exon2上的C90T和C203T,exon5上的C1038T,exon6上的C1107T和C1202T,exon8上的A1470C.其中C203T和C1202T这2个多态位点是错义突变,C203T位点的变异使V(缬氨酸)变成A(丙氨酸) ,C1202T位点的变异使V(缬氨酸)变成A(丙氨酸);其余4个多态位点是同义突变. 我们采用了PCR-RFLP、Bi-PASA和PCR-RFLP方法检测了5个位点的多态性,对3种绵羊类群进行了基因频率和基因型的X2检验,评价了TYRP1基因多态性与绵羊乌质性状和毛色之间的关系. 在C90T多态位点上,乌骨绵羊、兰坪本地绵羊的PIC都表现为中度多态;罗姆尼绵羊低度多态.在C203T多态位点上,乌骨绵羊和兰坪本地绵羊PIC都表现为低度多态;罗姆尼绵羊为中度多态.在C1107T多态位点上,三个类群绵羊的PIC都表现为中度多态.在C1202T多态位点上,三个类群绵羊的PIC都表现为中度多态.在A1470C多态位点上,乌骨绵羊、兰坪本地绵羊的PIC都表现为低度多态;罗姆尼绵为中度多态. 统计表明绵羊TYRP1基因C1107T、A1470C和C1202T位点的三种基因型与绵羊毛色无显著性差异(P>0.05),在C90T和C203T位点三种基因型与绵羊毛色差异显著(P<0.01). TYRP1基因C90T、C203T、C1107T、C1202T和A1470C位点上的基因型与绵羊乌质性状差异不显著(P>0.05). TYRP1基因C90T、C203T、C1107T、C1202T和A1470C位点的多态性与乌骨绵羊乌质性状没有显著关联.??
- 作者：
- 曹绣娟
- 学位授予单位：
- 云南农业大学
- 专业名称：
- 动物营养与饲料科学
- 授予学位：
- 硕士
- 学位年度：
- 2008年
- 导师姓名：
- 邓卫东
- 关键词：
- 乌骨绵羊；酪氨酸酶相关蛋白1基因；多态性；乌质性状
- Black-boned sheep；TYRP1 gene；Polymorphism；Black traits