云南省高致病性禽流感相关病原分子监测及基因变异分析
Molecule surveillance and gene variation analysis of correlation pathogen of highly pathogenic avian influenza in Yunnan province
为调查云南省禽流感混合感染相关病原的情况,本研究设计合成7对新城疫和免疫抑制病相关病原的RT-PCR检测引物,对云南省2007年10月至2009年1月期间175份禽流感(AI)阳性样品进行禽网状内皮增生病病毒(REV)、J亚群禽白血病病毒(ALV-J)、鸡传染性贫血病毒(CIAV)及新城疫病毒(NDV)的检测.结果,禽白血病病毒阳性27份,混合感染率为15.4%;禽网状内皮增生病病毒阳性40份,混合感染率为22.9%;禽传染性贫血病毒阳性47份,混合感染率为26.8%;共有30份样品发生多重感染,多重感染率为17.1%. 选择不同区域的4份禽白血病病毒阳性样品、10份禽网状内皮增生病病毒阳性样品、10份禽传染性贫血病毒阳性样品以及12份新城疫阳性样品进行了序列比对和系统发育分析.结果表明:云南ALV-J 毒株gp85基因与国外毒株 HPRS-103、ADOL-4817、ADOL-F88、ADOL-hc-1核苷酸及氨基酸同源性分别介于87.7-96.7%、 85.2-94.5% ,与国内毒株SD0001、IMC10200、HN0001、BJ0302、HB0301核苷酸及氨基酸同源性分别介于80.4-95.9%、 85.4-94.5%.云南REV毒株env基因核苷酸及氨基酸之间的同源性为98.8%-99.8%、 97.7%-99.5%.与国内外毒株SNV、HA9901、Binzhou01、ZD0708、CSDV、APC-566、TX-04的核苷酸序列和氨基酸之间的同源性都在95%以上.云南CIAV毒株vp2基因核苷酸及氨基酸之间的同源性在92.4%-100.0%、 93.7%-100.0%.与国外一些毒株Cux-1、SN0138QLD、BR367、CAV-15的核苷酸及氨基酸之间的同源性在92.1%-100.0%、 95.0%-100 %.云南省ND毒株F基因核苷酸之间的同源性为83.6%-99.6%,与常用的疫苗株之间的同源性为83.65%-99.6%.系统发育分析表明,云南省ND毒株主要属于基因型Ⅶ和基因型Ⅱ.基因型Ⅶ裂解位点氨基酸为R-R-Q-K-R-F,与传统认为强毒裂解位点氨基酸序列相同,基因型Ⅱ裂解位点氨基酸为G-R-Q-G-R-L,属于弱毒株裂解位点氨基酸排列特征.??
- 作者：
- 田建国
- 学位授予单位：
- 云南农业大学
- 专业名称：
- 预防兽医学
- 授予学位：
- 硕士
- 学位年度：
- 2009年
- 导师姓名：
- 尹革芬
- 关键词：
- 禽流感；gp85基因；env基因；vp2基因；F基因；序列分析
- Avian influenza；gp85 gene；Envelope gene；Vp2 gene；F gene；sequence analysis