策勒黑羊生长性状全基因组关联分析
策勒黑羊是一种以高繁殖性能为主要特征的优质羔皮绵羊,主要位于塔克拉玛干大沙漠南缘、昆仑山北麓的策勒县,具有全年发情和繁殖率高等优良特征。由于该群体遗传资源数量不多,科学合理地设计保种和利用方案,不仅能保证这一优质的遗传基因不流失,又能很好地为生产发展服务就显得尤为重要。因此,挖掘关于策勒黑羊生长性状相关的候选基因,对该品种的分子选育进程提供参考价值。试验一策勒黑羊母羊生长性状和脂尾特征的相关性分析针对策勒黑羊的脂尾性状,本研究采用了408只,年龄1.5～3岁的策勒黑羊母羊测定体重（y）、体高（x1）、体长（x2）、体斜长（x3）、胸宽（x4）、胸深（x5）、胸围（x6）、管围（x7）、尾长（x8）、尾宽（x9）和尾周长(x10),计算尾体积(x11),分析策勒黑羊母羊的尾体积差异,根据尾体积进行尾型分型,并对体重与尾脂性状和体尺指标进行相关性分析,构建体重的最优回归方程。结果表明,策勒黑羊母羊平均尾体积较大,平均尾体积为（18 108.51±11 868.52）cm~3,策勒黑羊母羊尾型分为小尾型、中尾型、大尾型和肥尾型;肥尾型策勒黑羊母羊的数量比较少（9只）,肥尾型的尾体积大小范围为50388.00～97 920.00 cm~3,平均尾体积为63 493.11 cm~3,中尾型数量较多（223只）,尾体积大小为12 000.00～29 988.00 cm~3,平均尾体积为18 505.93 cm~3;肥尾型的策勒黑羊母羊的体重、体长、体斜长、胸围、围长、尾宽和尾周长极显著大于其他三种尾型（P＜0.01）;母羊的体高、体长、体斜长、胸深、胸围、管围、尾长、尾宽和尾周长与体重均呈极显著正相关（P＜0.01）;构建的策勒黑羊母羊体重最优回归方程为y=0.152x5+0.078x6+0.146x9+0.284x2+6.430。说明策勒黑羊尾部性状与体重密切相关,揭示尾部性状对产肉性能具有一定影响,在策勒黑羊的生产性能测定和品种选育中要关注尾部性状。试验二策勒黑羊生长性状全基因组关联分析针对两个绵羊品种的生长发育性状,本研究采用Illumian Ovine SNP50 K Bead chip对184只德国肉用美利奴羊和策勒黑羊进行了基因分型和检测,通过GWAS结果分析获得并筛选出与生长性状相关的84个候选基因,包括:体重候选基因NELL1、PPARGC1A、BMPR1B、POMK、FABP5、CORT和PRL17等,体高候选基因PRSS58、NAB1、MEIS1和IGFBP7等,胸围候选基因SPATA17、HSPA8、MROH2A、HEATR7B1等,体长候选基因HSD17B3、RAD26L、EFNA5等基因。结合文献报道,PPARGC1A、BMPR1B、NELL1、EFNA5、FABP5和IGFBP7基因可作为生长性状和肉用性状重要候选基因进行进一步研究。试验三策勒黑羊BMPR1B和IGFBP7基因与生长性状的相关性分析针对策勒黑羊群体验证,本研究在第三章的基础下选择策勒黑羊生长性状主效基因（BMPR1B和IGFBP7）进行基因型分析,并与策勒黑羊生长性状进行关联分析。本研究群体验证采用90只策勒黑羊,测每一只羊的体重、体高、体长、体斜长、胸宽、胸深、胸围、管围、尾长、尾宽和尾周长等表型数据并对其血样进行采血提取DNA,对BMPR1B和IGFBP7等两种基因进测序。结果表明,在BMPR1B和IGFBP7等基因中发现2个SNPs。分别是g.431965A＞G和g.35468G＞A。其中,在策勒黑羊BMPR1B基因g.431965A＞G位点中AA基因型的体重、体高、体长、体斜长、胸宽、胸深、胸围、尾宽和尾周长极显著大于AG和GG基因型（P＜0.01）;在策勒黑羊IGFBP7基因g.35468G＞A位点中GG基因型的体重、体高、管围和胸深显著大于AA和AG基因型（P＜0.05）。研究结果对策勒黑羊育种计划制定有重要意义。总之,本研究是首次在策勒黑羊生长性状中开展的全基因组关联研究,同时也是关注一些尾型性状指标并利用最新绵羊基因组Ovis＿aries＿v4.0序列信息和GWAS方法进行的策勒黑羊生长性状主效基因的鉴定研究。研究结果对定位策勒黑羊数量性状座位（quantitative trait locus,QTL）和候选基因有重要的意义。同时也为探索策勒黑羊生长性状功能基因提供了重要的理论依据和参考。
- 作者：
- 米热妮萨·图尔荪托合提
- 学位授予单位：
- 塔里木大学
- 授予学位：
- 硕士
- 学位年度：
- 2023年
- 导师姓名：
- 刘书东
- 中图分类号：
- S826
- 关键词：
- 策勒黑羊；SNPs；生长性状；GWAS分析
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- 基金项目：
- 国家自然科学基金项目（项目编号:32060743）课题主持人:刘书东副教授%自治区农区高效肉羊品种选育推广技术体系（项目编号:xjngrg-g-2310）课题主持人:刘书东副教授%兵团财政科技计划（项目编号:2022CB001-09）课题主持人:刘书东副教授