新疆南疆马鹿肺炎克雷伯菌分子流行病学调查及耐药特性研究
为了解新疆南疆马鹿肺炎克雷伯菌分子流行病学特点、毒力基因及耐药特性,本研究采集新疆南疆4个鹿场马鹿鼻拭子和肛拭子样品,通过细菌学研究及PCR鉴定(肺炎克雷伯融血酵素khe基因),获得马鹿肺炎克雷伯菌分子流行病学调查结果;并对马鹿肺炎克雷伯菌分离株的荚膜血清型、毒力基因、耐药基因和耐药性进行分析,研究结果如下:1.采集新疆南疆4个鹿场马鹿185份鼻拭子和189份肛拭子样品,以肺炎克雷伯特异性溶血酵素khe基因特异性引物经PCR检测,鼻拭子检测出118份阳性样本,检出率为63.78%(118/185);肛拭子检测出76份阳性样本,检出率为40.21%(76/189);经细菌形态学观察、16S r RNA与khe基因的PCR鉴定,分离鉴定获得122株肺炎克雷伯菌分离株。2.对62株肺炎克雷伯菌分离株采用荚膜血清型分型特异性引物PCR检测,检测出K2型5株,检出率为8.06%;K5型8株,检出率为12.90%;K20型8株,检出率为12.90%;K57型34株检出率为54.84%。对62株分离株进行毒力基因PCR检测,检测出8种毒力基因,分别为wab G、uge、fim H、mrk D、ent B、ybt A、iut A和ure A,检出率分别为90.32%、88.71%、75.81%、90.32%、85.48%、24.19%、17.74%和85.48%。3.选取抗菌药物11类24种,对32株肺炎克雷伯菌分离株通过K-B药敏纸片法检测,结果显示分离株对部分抗菌药物耐药,其中红霉素、克林霉素、麦迪霉素、青霉素、羧苄西林、氨苄西林和多粘菌素B耐药率均为100%,耐药率最低的为头孢曲松、氧氟沙星和氯霉素耐药率为3.13%。32株分离株呈现多重耐药现象,最多耐8种抗菌药物,耐药率为37.5%。4.对62株肺炎克雷伯菌分离株进行9类24种耐药基因PCR检测,共检测出9种耐药基因:SHV、TEM、gyr A、par C、oqx A、oqx B、tet C、aac(3)-Ⅱa和Acr AB,不同耐药基因检出率分别为87.10%、80.65%、96.77%、85.48%、75.81%、43.55%%、25.81%、88.71%和79.03%。多重耐药基因占比最高为7种25.81%,最低含有2种、3种和5种耐药基因,占比均为3.23%。结论:从新疆南疆地区马鹿鼻拭子和肛拭子样本中均检测出肺炎克雷伯菌,检出率分别为63.78%和40.21%;分离菌株中以K2、K20、K5和K57血清型为主;毒力基因以wab G、uge和mrk D检出率较高;抗菌药物出现不同程度耐药,且存在多重耐药现象。
- 作者:
- 马纾薏
- 学位授予单位:
- 塔里木大学
- 授予学位:
- 博士
- 学位年度:
- 2022年
- 导师姓名:
- 胡建军;刘丽洁
- 中图分类号:
- S858.25
- 关键词:
- 马鹿;肺炎克雷伯菌;khe基因;毒力基因;耐药基因;耐药性
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- 基金项目:
- 国家自然基金科学基金地区基金项目“基于宏基因组学的新疆南疆马鹿腹泻病原检测及流行病学研究”的部分研究成果(项目编号:31860713),课题主持人:胡建军教授(塔里木大学)