新疆特色药用植物内生放线菌多样性分析及两株链霉菌新物种多相分类
新疆独特的地理生态环境蕴含着丰富的药用植物内生放线菌及其次级代谢产物资源,是药物研究开发的宝库。本文使用10种不同分离培养基,从甘草、罗布麻、柴胡、黑果枸杞、鹅绒藤和黑种草子等6种新疆特色药用植物中分离鉴定了834株内生放线菌,分布于5目6科9属,包括链霉菌（Streptomyces）、北里孢菌属（Kitasatospora）、马杜拉放线菌（Actinomadura）、拟诺卡氏菌属（Nocardiopsis）、类诺卡氏菌属（Nocardioides）、拟无枝酸菌属（Amycolatopsis）、诺卡氏菌属（Nocardia）、原小单孢菌属（Promicromonspora）和考克氏菌属（Kocuria）。其中优势菌属为链霉菌属（Streptomyces）,占分离菌株总数的60.89%。从罗布麻中分离鉴定的放线菌数量最多,为391株,占46.89%;其次是甘草,分离鉴定了124株,占14.87%。采用多相分类方法鉴定了2株内生放线菌新物种,分别为黑果枸杞根部内生放线菌新物种枸杞链霉菌（Streptomyces lycii）TRM 66187和罗布麻根部内生放线菌新物种罗布麻链霉菌（Streptomyces apocyni）TRM 66233。菌株TRM 66187全基因组大小为8.2 Mb,（G+C）%含量为71.8%,全细胞水解糖类型为核糖、半乳糖以及葡萄糖,全细胞氨基酸类型为L,L-二氨基庚二酸（L,L-diaminopimelic,L,L-DAP）,细胞膜磷脂类脂类型为双磷脂酰甘油（diphosphatidylglycerol,DPG）、磷脂酰胆碱（phosphatidylcholine,PC）、磷脂酰乙醇胺（phosphatidylethanolamine,PE）、磷脂酰肌醇（phosphatidylinositolsphos,PI）、磷脂酰肌醇甘露糖苷（phatidylinositol mannoside,PE）和一个未知类型的磷脂L1。该菌株主要的脂肪酸类型为iso-C14:0（8.12%）、iso-C15:0（9.98%）、anteiso-C15:0（10.33%）和anteiso-C16:0（14.67%）,主要的甲基萘醌类型为MK-9（H4）和MK-9（H6）。最适生长条件为37℃,1%NaCl,pH 7.0。保藏号为TRM 66187=CCTCC AA 2018094=LMG 31493。菌株TRM 66233全基因组大小7.03 Mb,（G+C）%含量为70.35%,全细胞水解糖类型为核糖和葡萄糖,全细胞氨基酸类型为L,L-二氨基庚二酸,细胞膜磷脂类型为磷脂酰乙醇胺（PE）、双磷脂酰甘油（DPG）、磷脂酰肌醇（PI）和四个未知类型的磷脂L1-L4。该菌株主要的脂肪酸类型为iso-C15:0（7.1%）、anteiso-C15:0（16.0%）、iso-C16:0（7.1%）、C16:0（8.4%）和iso-C17:0（3.7%）,主要的甲基萘醌类型为MK-9（H2）、MK-9（H6）、MK-9（H8）和MK-9(H10)。最适生长条件为32℃,1%NaCl,pH 7.0。保藏号为TRM 66233=CCTCC AA 2019056=LMG 31559。利用4种培养基对菌株TRM 66187进行发酵培养基筛选后,选取玉米淀粉培养基进行发酵。发酵液采用大孔树脂吸附的方法得到浸膏A,使用硅胶柱层析、凝胶柱层析、高效制备液相等方法从浸膏A中分离得到了1个化合物。使用NMR技术对化合物结构进行解析,最终确定该化合物为噻吩并妥林。
- 作者：
- 马丽冉
- 学位授予单位：
- 塔里木大学
- 授予学位：
- 硕士
- 学位年度：
- 2020年
- 导师姓名：
- 万传星
- 中图分类号：
- S567；Q939.1
- 关键词：
- 药用植物内生放线菌；多样性；多相分类；次生代谢产物；结构鉴定
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- 基金项目：
- "塔里木盆地放线菌资源代谢潜力的深度挖掘"项目(项目编号:U1703236)的部分研究成果,课题主持人:张利莉(塔里木大学)%"微生物资源利用兵团重点领域创新团队"项目(项目编号:2017CB014)的部分研究成果,课题主持人:万传星教授(塔里木大学)%兵团中青年科技创新领军人才计划项目"特殊生境放线菌沉默基因簇的挖掘" (项目编号:2019CB030)的部分研究成果,课题主持人:罗晓霞教授(塔里木大学)