白菜BIL群体和DH群体的遗传图谱构建及其比较
Construction and Comparision of Brassica Campestris Genetic Maps for Backcross Inbred Lines and Doubled Haploid from the Same Parents
白菜是十字花科芸苔属中最重要的蔬菜作物之一.我国大白菜和小白菜的年播种面积和产量约占全国蔬菜的20%,在蔬菜生产中具有举足轻重的地位.本研究是利用相同亲本构建的BIL群体和DH群体为材料,分别构建了DH群体遗传连锁图谱和BIL群体遗传连锁图谱,并进行了图谱比较研究,为今后利用遗传连锁图谱进行大白菜各种性状的QTL定位、图位克隆基因和分子标记辅助育种奠定基础.主要研究结果如下:(1)以大白菜品种Z16*白菜型油菜品种L144的F1DH群体为材料,构建了包含105个SSR标记和140个SRAP标记的10个连锁群遗传图谱,总长度714cM,平均图距为2.9cM.每个连锁群上的标记数在13-50个之间,连锁群长度为45.8-100.9cM.并进行了标记的偏分离分析,168个标记发生偏分离,占68.57%,其中偏向Z16的占58.77%,偏向于L144的占9.80%.(2)根据连锁图谱中已知的SSR标记,可初步确定8C系列SSR标记在连锁群中的位置.在已公布的BRMS系列引物中,BRMS016、BRMS030、BRMS046没有定位在相应的连锁群,本研究把BRMS016、BRMS030定位A09连锁群上、BRMS046定位在A02连锁群上.(3)以大白菜品种Z16*白菜型油菜品种L144的BIL群体为材料,构建了包含82个SSR标记和102个SRAP标记的13个连锁群遗传图谱,总长度453.7cM,平均图距为2.47cM.每个连锁群上的标记数在4-40个之间,连锁群长度为8.7-70.8cM.(4)用DH群体连锁群遗传图谱的97个SSR标记研究供体亲本L144的染色体片段在BIL群体中覆盖基因组比率.结果表明,在BIL群体的每个单株中,供体亲本L144的基因组片段所占的比率为0.84%-35.00%,平均为11.31%,接近理论遗传预期值12.50%.在25个BC2 BIL群体的每个群体中,供体亲本L144的基因组片段所占的比率为1.69%-27.36%,平均比率为11.03%.(5)对两种群体构建的遗传连锁图谱进行比较,发现BIL群体遗传图谱中有些连锁群存在10cM以上的大间隙,并出现断离的连锁群,导致其连锁群数目多于10个连锁群,其中LG3、LG4对应于DH群体遗传图谱的A03连锁群,而LG12、LG13没有相应的连锁群;在两种遗传连锁图谱共有的58个SSR标记中,有43个标记存在线性对应关系,15个标记没有线性对应关系.
- 作者：
- 汪骞
- 学位授予单位：
- 云南农业大学
- 专业名称：
- 作物遗传育种
- 授予学位：
- 硕士
- 学位年度：
- 2009年
- 导师姓名：
- 林良斌；王晓武
- 中图分类号：
- S634.1
- 关键词：
- 白菜；遗传图谱；SSR标记；SRAP标记；DH群体；BIL群体
- Chinese cabbage-pak-choi；genetic map；SSR marker；SRAP marker；backcross Inbred Lines(BIL)population；doubled haploid(DH)population