甘肃肉羊新品种群高繁殖力候选基因GnRHR、GDF9和BMP15多态性及其与繁殖力关系的研究
Plymorphisms of GnRHR、GDF9&BMP15 Genes and Their Relationship with Prolificacy in Gansu Meat Sheep New Breed Population
本研究以204只甘肃肉羊新品种选育群羊和32只无角陶赛特羊为研究素材,以GDF9、BMP15、GnRHR基因的多态性为研究内容,采用PCR-SSCP技术并结合DNA测序技术分析了新品种选育群羊GDF9、BMP15基因的外显子1和2,以及GnRHR基因的外显子2和3在新品种选育群羊中的多态性,并探讨了候选基因与新品种选育群羊产羔数之间的关系,为下一步采用分子标记辅助选择进行甘肃肉羊新品种育种提供可借鉴的遗传学资料,具体研究结果如下:1.建立了检测绵羊GDF9基因、BMP15(GDF9B)基因、GnRHR基因突变的最佳PCR-SSCP方法,摸索出了三个候选基因最佳PCR-SSCP条件。2.对于引物1扩增BMP15基因外显子1,在新品种选育群羊检测到AA、AB、BB基因型,其基因型频率分别为0.618(126)、0.328(67)、0.054(11),而无角陶赛特羊只检测到AA基因型。引物1多态片段测序分析表明:BMP15基因外显子1的246bp(cDNA28bp)缺失了3个碱基CTT。造成了被翻译的氨基酸序列的信号肽中减少了一个亮氨酸。实验结果统计分析显示:BMP15基因外显子1中虽然存在突变位点(cDNA28bp处开始缺失了3个碱基CTT),但该突变对新品种群羊繁殖力高低没有显著影响。3.对于引物7和引物10扩增GDF9基因外显子1和2,在新品种选育群羊GDF9基因外显子1检测到CC、CD基因型,基因型频率分别为0.946(193)、0.054(11);GDF9基因外显子2检测到EE、EF、FF基因型,基因型频率0.701(143)、0.221(45)、0.078(16);引物7和引物10多态片段测序分析表明:GDF基因外显子1和2,分别在编码区第260位碱基发生突变G→A,导致R变成H(精氨酸→组氨酸);第994位碱基发生突变G→A,导致V变成I(缬氨酸→异亮氨酸)。GDF基因外显子1突变对新品种群羊繁殖力高低影响显著,突变杂合基因型(CD)绵羊平均产羔数比野生纯合型(CC)多0.733只(P=0.0380.05)。4.对于引物12和引物13扩增GnRHR基因外显子2和3,在新品种选育群羊GnRHR基因外显子2检测到GG、GH、HH基因型,基因型频率为0.784(160)、0.206(42)、0.010(2);GnRHR基因外显子3检测到MM、MN基因型,基因型频率为0.882(180)、0.118(24);引物12和引物13多态片段测序分析表明:GnRHR基因外显子2和3,分别在编码区第198位碱基发生突变G→C,导致G变成R(甘氨酸→精氨酸);第257位碱基发生突变A→G,导致Q变成R(谷氨酰胺→精氨酸)。GnRHR基因外显子2突变对新品种群羊繁殖力高低影响极显著,突变纯合基因型(HH)绵羊平均产羔数比野生纯合型(GG)多0.981只(P=0.006<0.01),外显子3突变对新品种群羊繁殖力高低也有显著影响。MN基因型羊平均产羔数分别比MM基因型多0.688只(P=0.029<0.05)。
- 作者:
- 朱爱文
- 学位授予单位:
- 甘肃农业大学
- 专业名称:
- 动物生产系统与工程
- 授予学位:
- 硕士
- 学位年度:
- 2010年
- 导师姓名:
- 马友记;李发弟;陈国宏
- 中图分类号:
- S826
- 关键词:
- GDF9基因;BMP15(GDF9B)基因;GnRHR基因;单链构象多态性(SSCP)
- Growth differentiation factor(GDF9)Gene;BMP15 Gene;GnRHR Gene;Single-strand conformation polymorphism(SSCP)
- 基金项目:
- 甘肃省自然科学