蓖麻株高性状的RAPD分子标记研究
本研究以蓖麻高、矮杆亲本为供试材料,利用RAPD分子标记技术结合BSA法,筛选与株高基因相关的分子标记。主要研究结果如下: 1.采用CTAB法成功地提取了蓖麻基因组DNA。通过对RAPD-PCR影响因素的分析,优化了适合本研究的RAPD-PCR体系及扩增程序。反应体系为:25μl体系中含引物0.36μnol/L、dNTP0.24mmol/L、Taq酶0.05U/μl、Mg2+1.2mmol/L。扩增程序为:94℃预变性2min;94℃变性45s,36℃退火45s,72℃延伸75s,35个循环;最后72℃复延伸5min。 2.利用200个10bp随机引物对高秆亲本基因池和矮杆亲本基因池间进行RAPD多态性分析,共扩增出1021条DNA谱带,每个引物可扩增谱带数2~13条,谱带大小200bp-2000bp。最终选出1个在高、矮亲本植株间产生差异性扩增谱带的引物-S1500,并利用该引物标记出2个与株高性状相关基因的差异片段。通过进一步在群体上进行验证,确认了这2个标记片段的真实性。根据这2个标记片段的长度将其命名为S15002200和S15001600。 3.将S15002200和S15001600差异片段切胶回收,连接到pGEM-T Easy克隆质粒载体上,转化到大肠杆菌JM109,经质粒酶切鉴定后并测序,获得了该标记的核苷酸序列,其大小分别为S15002200:2242bp和S15001600:1690bp。并将其命名为S15002242和S15001690。 4.在NCBI Genebank数据库中,对S15002242和S15001690进行了序列比对,未发现有与其他生物的DNA序列具有大量同源性的基因。对S15002242标记和S15001690标记之间进行序列比对,两者之间同源性达35.73%,表明这两个片段之间有一部分在同一位置上。可以推测认为S15002242标记和S15001690标记位于蓖麻植株高度相关基因上。
- 作者:
- 姚远
- 学位授予单位:
- 内蒙古民族大学
- 专业名称:
- 作物栽培学与耕作学
- 授予学位:
- 硕士
- 学位年度:
- 2009年
- 导师姓名:
- 李凤山;陈永胜
- 中图分类号:
- S565.6
- 关键词:
- 蓖麻;株高性状;分子标记;RAPD
- Castorbean;Plant height character;Molecular marker;RAPD