红树林土壤宏基因组文库中纤维素酶克隆子的筛选和鉴定
本研究对包含有8448个克隆子的红树林土壤宏基因组文库进行纤维素酶活性筛选，筛选得到44个表达内切葡聚糖酶活性的克隆、9个表达β-葡萄糖苷酶活性的克隆和5个表达外切葡聚糖酶活性的克隆，分别占总克隆子数的0.52％、0.11％、0.06％。从中挑选了两株ZD12E10和SD08D3表达内切葡聚糖酶活性较强的克隆，一株ZS06H8表达β-葡萄糖苷酶活性较强的克隆进行测序。得到一个内切葡聚糖酶活性相关的核酸片段NQX10和一个内切葡聚糖酶活性相关的基因NOX3，一个表达β-葡萄糖苷酶活性相关的基因BTX8。 NQX10核酸片段全长为1758bp，其编码的蛋白质由586个氨基酸组成，蛋白质预计的分子质量为66191.55Da，其编码产物与一个来源于Bacillusthuringiensis的细胞壁降解酶蛋白(Cellwalldegradationprotein)的一致性为97％，相似性为95％，还与Oceanobacillusiheyensis的peptidoglycanhydrolase的一致性为48％，相似性为25％。 NQX3基因全长为336bp，其编码的蛋白质由120个氨基酸组成，蛋白质预计的分子质量为13423.65Da，其编码产物与一个来源于Aspergillusniger的hypotheticalprotein的一致性为66％，相似性为51％，NQX3基因是一个的新基因。 BTX8基因全长为1536bp，其编码的蛋白质由511个氨基酸组成，蛋白质的分子质量为55828.51Da，其编码产物与一个来源于Clostridiumthermocellum(热纤梭菌)的IMPcyclohydrolase的一致性为83％，相似性为66％，推测该基因可能是一个全新的基因。
- 作者：
- 郭利芳
- 学位授予单位：
- 海南大学
- 专业名称：
- 农产品加工及贮藏
- 授予学位：
- 硕士
- 学位年度：
- 2008年
- 导师姓名：
- 刘四新；洪葵
- 中图分类号：
- S714.33
- 关键词：
- 红树林；纤维素酶；克隆子筛选；宏基因组文库；微生物
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